memo
Journal

Computer Methods & Programs in Biomedicine
http://intl.elsevierhealth.com/journals/cmpb/

Source Code for Biology and Medicine
http://www.scfbm.org/home/

Image Processing Libraries

OpenCV (http://sourceforge.net/projects/opencvlibrary/)
Gimp (http://www.gimp.org)
Vigra (http://kogs-www.informatik.uni-hamburg.de/~koethe/vigra/)
Vips (http://www.vips.ecs.soton.ac.uk/)
VXL (http://vxl.sourceforge.net/)
CImg (http://cimg.sourceforge.net/)
Gegl (http://www.gegl.org/, http://pippin.gimp.org/gegl/)
ImageMagick/GraphicsMagick (http://imagemagick.org/, http://www.graphicsmagick.org/)
GIL (http://opensource.adobe.com/gil/)
CxImage (http://www.codeproject.com/bitmap/cximage.asp)
FreeImage (http://freeimage.sourceforge.net/)

Application

EDTIPS: 医用画像に特化したWindows用2D/3Dレンダラ
http://www.cc.nih.gov/drd/etdips.html

Sarensix.ビデオ画像からの超解像ツール.有償.
http://www.pyramidvision.com/products/sarensix/index.asp

ImageJ Plugins

Extended Depth of Field
XYZデータからの合焦点像作成.立体物の明視野観察で利用することが多いようだ.蛍光像ではもっと簡単な最大輝度投影や平均輝度投影が一般的だが,本手法を使ってみると思わぬ効果が得られるかもしれない.
http://bigwww.epfl.ch/demo/edf/
Forster et al. (2004) Microsc Res Tech 65: 33-42.

active contour
LiveWire
http://ivussnakes.sourceforge.net/

deconvolution plugins
DeconvolutionJ from Nick Linnenbrügger (last update 2002)
IterativeDeconvolve3D from Bob Dougherty at Optinav (last update 2005,)
3D Deconvolution by Pierre Besson at BIG

Bio-Formats.顕微鏡関連各種画像フォーマット用Javaライブラリ
http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html

MTrackJ.Manual Object Tracking
http://www.imagescience.org/meijering/software/mtrackj/

Key words
Circular Statistics
非線形最小自乗法のLevenberg-Marquardt法

Others

Graphviz - Graph Visualization Software
http://www.graphviz.org/Gallery.php

Ludl社製コントローラのソフトウェア制御のための通信仕様書等
http://www.ludl.com/StartSupport.html

EastRGB.各種色空間相互の変換式/変換コード
http://www.easyrgb.com/math.php

SDLdoc 日本語翻訳プロジェクト
http://zinnia.dyndns.org/~cvsweb/sdldoc-jp/

Pygame入門
http://www.halb-katze.jp/pygt/index.html

初心者のためのpygameガイド(邦訳)
http://www.unixuser.org/~euske/doc/pygame/newbieguide-j.html

画像特徴点の提案と,それに基づくパノラマ写真の合成
SIFT (Scale Invariant Feature Transform) Keypoint Detector
http://www.cs.ubc.ca/~lowe/keypoints/
http://www.cs.ubc.ca/~mbrown/panorama/panorama.html

コーナー検出のための各種画像特徴点
http://en.wikipedia.org/wiki/Corner_detection

Open Source Web Design (XHTMLとCSS)
http://www.oswd.org/

2値ラスター画像のベクター化
http://potrace.sourceforge.net/

ベイズウィキ
http://hawaii.aist-nara.ac.jp/~shige-o/pukiwiki/index.php?FrontPage

Octave
http://www.al.cs.kobe-u.ac.jp/~inamoto/unix-tools/useful/octave/
http://www.rbt.his.fukui-u.ac.jp/~naniwa/pub/octave.html
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by edogawadai_bio | 2007-04-06 07:29 | img
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