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ICA
タンパク質-タンパク質の相互作用を解析するなど,多重染色蛍光像で共局在を調べる際の客観的・定量的基準として各画素の輝度についてバンド間での相関係数を求める例をこのところよく見かける.intensity correlation analysisからICAと略されることがあるが,どうもindependent component analysisとまぎらわしい.

総説.雑誌のカラーとだいぶ違うような気がする….
Penarrubia PG et al. (2005)
Quantitative analysis of the factors that affect the determination of colocalization coefficients in dual-color confocal images.
IEEE Trans Image Process 14: 1151-1158.

単純なピアソンの相関係数が標準的なようだが,よりよい測度を検討する研究もある.
Costes SV et al. (2004)
Automatic and quantitative measurement of protein-protein colocalization in live cells.
Biophys J 86: 3993–4003.
http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1304300
# 掲載後1年経ったBiophys Jの記事はPubMed Centralで読める.
by edogawadai_bio | 2006-09-22 23:25 | img
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